| ヤクルト | |
| × | 高山 俊 （明大、外野手、右左） |
| 1位 | 原 樹理 （東洋大、投手、右右） |
| 2位 | 広岡 大志 （智弁学園、内野手、右右） |
| 3位 | 高橋 奎二 （龍谷大平安、投手、左左） |
| 4位 | 日隈 ジュリアス （高知中央、投手、左左） |
| 5位 | 山崎 晃大朗 （日大、外野手、左左） |
| 6位 | 渡辺 大樹 （専大松戸、内野手、右右） |
| 選択終了 | |
| ソフトバンク | |
| 1位 | 高橋 純平 （県岐阜商、投手、右右） ◎ |
| 2位 | 小沢 怜史 （日大三島、投手、右左） |
| 3位 | 谷川原 健太 （豊橋中央、捕手、右左） |
| 4位 | 茶谷 健太 （帝京三、投手、右右） |
| 5位 | 黒瀬 健太 （初芝橋本、内野手、右右） |
| 6位 | 川瀬 晃 （大分商、内野手、右左） |
| 選択終了 | |
| 育成1位 | 野沢 佑斗 （つくば秀英、投手、右左） |
| 育成2位 | 児玉 龍也 （神奈川大、投手、左両） |
| 育成3位 | 樋越 優一 （東農大北海道、捕手、右左） |
| 育成4位 | 中村 晨 （ルーテル学院、投手、右右） |
| 育成5位 | 渡辺 健史 （飯塚、投手、左左） |
| 選択終了 | |
| 巨人 | |
| 1位 | 桜井 俊貴 （立命大、投手、右右） |
| 2位 | 重信 慎之介 （早大、外野手、右左） |
| 3位 | 与那原 大剛 （普天間、投手、右右） |
| 4位 | 宇佐見 真吾 （城西国際大、捕手、右左） |
| 5位 | 山本 泰寛 （慶大、内野手、右右） |
| 6位 | 巽 大介 （岩倉、投手、左左） |
| 7位 | 中川 皓太 （東海大、投手、左左） |
| 8位 | 松崎 啄也 （日本製紙石巻、内野手、右右） |
| 選択終了 | |
| 育成1位 | 増田 大輝 （四国ＩＬ・徳島、内野手、右右） |
| 育成2位 | 小林 大誠 （武蔵ヒートベアーズ、捕手、右左） |
| 育成3位 | 松沢 裕介 （四国ＩＬ・香川、外野手、左左） |
| 育成4位 | 田島 洸成 （武蔵ヒートベアーズ、内野手、右左） |
| 育成5位 | 大竹 秀義 （武蔵ヒートベアーズ、投手、右左） |
| 育成6位 | 山下 篤郎 （鎮西、投手、左左） |
| 育成7位 | 矢島 陽平 （武蔵ヒートベアーズ、投手、右右） |
| 育成8位 | 長谷川 潤 （石川ミリオンスターズ、投手、右右） |
| 選択終了 | |
| 日本ハム | |
| × | 高橋 純平 （県岐阜商、投手、右右） |
| × | 小笠原 慎之介 （東海大相模、投手、左左） |
| 1位 | 上原 健太 （明大、投手、左左） |
| 2位 | 加藤 貴之 （新日鉄住金かずさマジック、投手、左左） |
| 3位 | 井口 和朋 （東農大北海道、投手、右右） |
| 4位 | 平沼 翔太 （敦賀気比、内野手、右左） |
| 5位 | 田中 豊樹 （日本文理大、投手、右右） |
| 6位 | 横尾 俊建 （慶大、内野手、右右） |
| 7位 | 吉田 侑樹 （東海大、投手、右右） |
| 8位 | 姫野 優也 （大阪偕星、外野手、右右） |
| 選択終了 | |
| 阪神 | |
| 1位 | 高山 俊 （明大、外野手、右左） ◎ |
| 2位 | 坂本 誠志郎 （明大、捕手、右右） |
| 3位 | 竹安 大知 （熊本ゴールデンラークス、投手、右右） |
| 4位 | 望月 惇志 （横浜創学館、投手、右右） |
| 5位 | 青柳 晃洋 （帝京大、投手、右右） |
| 6位 | 板山 祐太郎 （亜大、外野手、右左） |
| 選択終了 | |
| ロッテ | |
| 1位 | 平沢 大河 （仙台育英、内野手、右左） ◎ |
| 2位 | 関谷 亮太 （JR東日本、投手、右右） |
| 3位 | 成田 翔 （秋田商、投手、左左） |
| 4位 | 東條 大樹 （ＪＲ東日本、投手、右右） |
| 5位 | 原 嵩 （専大松戸、投手、右右） |
| 6位 | 信楽 晃史 （宮崎梅田学園、投手、右右） |
| 7位 | 高野 圭佑 （ＪＲ西日本、投手、右右） |
| 選択終了 | |
| 育成1位 | 大木 貴将 （四国ＩＬ・香川、内野手、右左） |
| 育成2位 | 柿沼 友哉 （日本大学国際関係学部、捕手、右右） |
| 選択終了 | |
| 広島 | |
| 1位 | 岡田 明丈 （大商大、投手、右左） |
| 2位 | 横山 弘樹 （NTT東日本、投手、右左） |
| 3位 | 高橋 樹也 （花巻東、投手、左左） |
| 4位 | 船越 涼太 （王子、捕手、右右） |
| 5位 | 西川 龍馬 （王子、内野手、右左） |
| 6位 | 仲尾次 オスカル （ホンダ、投手、左左） |
| 7位 | 青木 陸 （山形中央、内野手、右右） |
| 選択終了 | |
| 西武 | |
| 1位 | 多和田 真三郎 （富士大、投手、右右） |
| 2位 | 川越 誠司 （北海学園大、投手、左左） |
| 3位 | 野田 昇吾 （西濃運輸、投手、左左） |
| 4位 | 大滝 愛斗 （花咲徳栄、外野手、右右） |
| 5位 | 南川 忠亮 （ＪＲ四国、投手、右右） |
| 6位 | 本田 圭佑 （東北学院大、投手、右右） |
| 7位 | 呉 念庭 （第一工業大、内野手、右右） |
| 8位 | 国場 翼 （第一工業大、投手、右右） |
| 9位 | 藤田 航生 （弘前工、投手、左左） |
| 10位 | 松本 直晃 （四国ＩＬ・香川、投手、右右） |
| 選択終了 | |
| 中日 | |
| × | 高橋 純平 （県岐阜商、投手、右右） |
| 1位 | 小笠原 慎之介 （東海大相模、投手、左左） ◎ |
| 2位 | 佐藤 優 （東北福祉大、投手、右左） |
| 3位 | 木下 拓哉 （トヨタ自動車、捕手、右右） |
| 4位 | 福 敬登 （ＪＲ九州、投手、左左） |
| 5位 | 阿部 寿樹 （ホンダ、内野手、右右） |
| 6位 | 石岡 諒太 （ＪＲ東日本、内野手、左左） |
| 選択終了 | |
| 育成1位 | 中川 誠也 （愛知大、投手、左左） |
| 育成2位 | 吉田 嵩 （四国ＩＬ・徳島、投手、右右） |
| 育成3位 | 三ツ間 卓也 （武蔵ヒートベアーズ、投手、右右） |
| 育成4位 | 西浜 幹紘 （星城大、投手、右右） |
| 育成5位 | 呉屋 開斗 （八戸学院光星、投手、左左） |
| 育成6位 | 渡辺 勝 （東海大、外野手、右左） |
| 選択終了 | |
| オリックス | |
| 1位 | 吉田 正尚 （青学大、外野手、右左） |
| 2位 | 近藤 大亮 （パナソニック、投手、右右） |
| 3位 | 大城 滉二 （立大、内野手、右右） |
| 4位 | 青山 大紀 （トヨタ自動車、投手、右左） |
| 5位 | 吉田 凌 （東海大相模、投手、右右） |
| 6位 | 佐藤 世那 （仙台育英、投手、右右） |
| 7位 | 鈴木 昴平 （三菱重工名古屋、内野手、右右） |
| 8位 | 角屋 龍太 （ジェイプロジェクト、投手、右右） |
| 9位 | 赤間 謙 （鷺宮製作所、投手、右右） |
| 10位 | 杉本 裕太郎 （ＪＲ西日本、外野手、右右） |
| 選択終了 | |
| 育成1位 | 塚田 貴之 （白鴎大、投手、左左） |
| 育成2位 | 赤松 幸輔 （四国ＩＬ・香川、捕手、右右） |
| 選択終了 | |
| ＤｅＮＡ | |
| 1位 | 今永 昇太 （駒大、投手、左左） |
| 2位 | 熊原 健人 （仙台大、投手、右左） |
| 3位 | 柴田 竜拓 （国学院大、内野手、右左） |
| 4位 | 戸柱 恭孝 （ＮＴＴ西日本、捕手、右左） |
| 5位 | 綾部 翔 （霞ケ浦、投手、右右） |
| 6位 | 青柳 昴樹 （大阪桐蔭、外野手、右右） |
| 7位 | 野川 拓斗 （鷺宮製作所、投手、左左） |
| 選択終了 | |
| 育成1位 | 網谷 圭将 （千葉英和、捕手、右右） |
| 育成2位 | 山本 武白志 （九州国際大付、内野手、右右） |
| 育成3位 | 田村 丈 （関西学院大、投手、右右） |
| 選択終了 | |
| 楽天 | |
| × | 平沢 大河 （仙台育英、内野手、右左） |
| 1位 | オコエ 瑠偉 （関東一、外野手、右右） |
| 2位 | 吉持 亮汰 （大商大、内野手、右右） |
| 3位 | 茂木 栄五郎 （早大、内野手、右左） |
| 4位 | 堀内 謙伍 （静岡、捕手、右左） |
| 5位 | 石橋 良太 （ホンダ、投手、右左） |
| 6位 | 足立 祐一 （パナソニック、捕手、右右） |
| 7位 | 村林 一輝 （大塚、内野手、右右） |
| 選択終了 | |
| 育成1位 | 出口 匠 （津田学園、内野手、右右） |
| 育成2位 | 山田 大樹 （菰野、内野手、右左） |
| 選択終了 | |
